污水处理费是按照“污染者付费”原则，由排水单位和个人缴纳并专项用于城镇污水处理设施建设、运行和污泥处理处置的资金。向城镇排水与污水处理设施排放污水、废水的单位和个人(以下称缴纳义务人)，应当缴纳污水处理费。污水处理费属于政府非税收入，全额上缴地方国库，纳入地方政府性基金预算管理，实行专款专用。2014年1月1日起实施的中华人民共和国国务院令第641号文件《城镇排水与污水处理条例》指出：污水处理费的收费标准不应低于城镇污水处理设施正常运营的成本。因特殊原因，收取的污水处理费不足以支付城镇污水处理设施正常运营的成本的，地方人民政府给予补贴。居民缴纳的污水处理费，在地方政府购买水处理服务中，可作为政府补贴的费用来源，但与污水厂的收入并没有直接关系。
污水处理属于政府的公共服务范畴，由政府委托污水处理企业进行投资、运营，并对企业支付相应费用。具体费用根据企业成本及合理利润，以合同的形式约定。虽然目前水务上市公司看起来毛利率较高，但据四大会计师事务所相关人士介绍，这和会计处理方式有很大关系。首先污水处理厂为重资产投资，资金回收期限长，企业需长期承担金额巨大的融资成本，而这部分融资成本的会计核算在项目运营期不计入成本，毛利率的计算并未扣除该部分融资成本。另外，对于香港上市的公司，还受香港会计准则的影响。在香港会计准则下，将其初始投资成本多认定为金融资产，不计入成本，而且冲抵收入，这样计算出来的毛利率会较传统投资成本进行折旧摊销的方式要高很多。
根据wind数据显示，水务行业2015年平均资产收益率仅为4.2%，且近年来随着竞争加剧，新项目的收益率呈不断下降趋势。虽然行业利润不高，但收益相对稳定、长期，同时个别企业会因为管理及效率的不同，而实际利润有些偏差。
